В 2004 году вышла первая трехмерная Ninja Gaiden и открыла новую эпоху игр про ниндзя, в которых такие воины могут противостоять не только бойцам схожего класса, но и морпехам с автоматами, вертолетам и даже танкам - для настоящего ниндзя нет непобедимого врага. В игре было несколько потрясающих находок, которые потом копировались из игры в игру, например, резкий удар с воздуха, отрубающий врагам головы и конечности.
Свой вклад в развитие идеи ниндзя внес и Хидео Кодзима. Его Грэй Фокс из серии Metal Gear эволюционировал в новую форму Райдена в Metal Gear Solid IV: Guns of the Patriots (2008), после чего Райден получил собственный слэшер Metal Gear Rising: Revengeance (2013).
Оседлать ту же волну успеха хотела и и From Software с Ninja Blade, однако эта игра не получила такого культового статуса, как остальные проекты студии. Зато умельцы из From потом оторвались в 2018 году с выходом Sekiro: Shadows Die Twice, хотя технически ее слэшером не назовешь - это все-таки уже была эволюция soulslike.
В 2025 году вышли не только двухмерные Ninja Gaiden: Ragebound и Shinobi: Art of Vengeance, но и трехмерные Assassin’s Creed Shadows, ремейк Ninja Gaiden 2 Black и новая номерная часть Ninja Gaiden 4, что в очередной раз доказывает, что игры (и в том числе слэшеры) про ниндзя - живее всех живых.